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染色质构象捕获(Hi-C)

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染色质构象捕获(Hi-C)

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项目介绍

Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture, 3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获,获得高分辨率的染色质三维结构信息。

技术特点:

 1. 研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系

 2. 基因组组装组装水平提升到染色体水平。

 3. 无需群体,单个个体就能实现染色体定位,周期短,成本低

 4. 相对遗传图谱,标记密度更大,序列定位更完整

实验流程:

分析流程:

标准分析

(1) 数据过滤及比对

(2) ChIP分布趋势分析

高级分析

(3) 染色体互作分析

(4) 与ChIP联合分析

(5) 转录组联合分析

(6) 染色体三维结构模型构建

样品要求

细胞数:≥1ⅹ107     交联固定后干冰运输

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染色质构象捕获(Hi-C)

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