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    染色质构象捕获(Hi-C)

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    染色质构象捕获(Hi-C)

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    项目介绍

    Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture, 3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,通过对染色质内全部DNA相互作用模式进行捕获,获得高分辨率的染色质三维结构信息。

    技术特点:

     1. 研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系

     2. 基因组组装组装水平提升到染色体水平。

     3. 无需群体,单个个体就能实现染色体定位,周期短,成本低

     4. 相对遗传图谱,标记密度更大,序列定位更完整

    实验流程:

    分析流程:

    标准分析

    (1) 数据过滤及比对

    (2) ChIP分布趋势分析

    高级分析

    (3) 染色体互作分析

    (4) 与ChIP联合分析

    (5) 转录组联合分析

    (6) 染色体三维结构模型构建

    样品要求

    细胞数:≥1ⅹ107     交联固定后干冰运输

    项目案例
    学术文章

    染色质构象捕获(Hi-C)

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