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长链非编码RNA(lncRNA)

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长链非编码RNA(lncRNA)

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项目介绍

长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,它们不编码蛋白。lncRNA的表达受到发育调控,是组织和细胞特异的。相当一部分lncRNA只位于细胞核内。它们包含许多类型的转录本,在结构上类似mRNA,有时也转录成编码基因的反义转录本。lncRNA被认为执行了重要的调控功能,也与疾病发展息息相关。

技术特点

 1. lncRNA在不同的发育阶段lncRNA的表达水平不同

 2. 在不同的癌组织或其他疾病中,lncRNA差异性表达

 3. LncRNA的调控机制多元化、复杂性高,在细胞中存在数量是mRNA的3~100倍

技术流程

图中深色为该技术流程

分析流程:

标准分析

(1) 数据过滤及比对分析

(2) 转录本拼接

高级分析

(3) LncRNA的筛选及分析

(4) 靶基因预测

(5) 差异基因GO/KEGG分析,推测突变基因富集在哪些代谢通路。

样品要求

样本要求:

RNA浓度≥20ng/ul 总量≥2ug    

细胞数≥5X106

项目案例

差异分析聚类图

靶基预测图

学术文章

长链非编码RNA(lncRNA)

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