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高分辨空间代谢组

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项目介绍

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing )采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段并进行高通量测序。研究者通过MeDIP Sequencing可以快速有效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同样本间DNA甲基化修饰模式的差异。此方法可以覆盖整个基因组范围的甲基化区域并且成本较低,特别适用于多样品的全基因组DNA表观遗传研究。

技术特点

1、检测疾病样本中DNA甲基化信号富集区域并推断样本中表达被 抑制的候选基因集合。

2、检测疾病发生发展不同时期,病灶部位的DNA甲基化动态图谱,筛选表观遗传标志帮助界定疾病发展程度。

3、比较疾病样本和正常样本中DNA甲基化区域的信号和位置分布的差异,筛选疾病特异性DNA甲基化区域,观察这些区域周围的基因,缩小疾病相关候选基因范围。

实验流程

分析流程

标准分析

(1) 数据过滤及比对

(2) MeDIP分布趋势分析

高级分析

(3) MeDIP富集peak信息

(4) 基于peak的多样品间差异分析

样品要求

样本要求:

DNA浓度≥10ng/ul ,总量≥2ug    

细胞数≥1ⅹ107

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