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N-糖基化蛋白质组学

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项目介绍

N糖基化是指蛋白质在酶的作用下将糖链连接到蛋白质特定氨基酸形成糖苷键的过程。细胞内超过 50% 的蛋白质都有一个或多个糖链。连接于天冬酰胺（Asn）残基上的N-糖基化在真核生物中广为存在，也是研究最为深入的一种糖基化形式。蛋白质N-糖基化修饰主要在复杂的多细胞或组织形成过程中起关键作用，参与细胞识别、免疫应答、细胞分化等生命活动。蛋白质经酶解后利用凝集素（lectin）富集N-糖基化肽段，再用N-糖酰胺酶（PNGase）在重水中切除糖链，然后通过LC-MS/MS对糖基化位点进行分析，实现大规模N-糖基化蛋白质定性定量分析。

技术路线

数据分析

1、标准数据分析内容

鉴定分析：鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图。

表达差异分析：差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图。

多组的比较分析(组别>=3)：mufzz聚类;雷达图;箱线图。

功能分析：亚细胞定位;结构域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作网络分析。

质量控制分析：肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布。

2、高级数据分析

功能分析：GSEA富集分析。

临床药物研究：药物靶点注释。

标志物筛选：集成机器学习。

与临床表征的联合分析：热图;弦图;ROC分析;WGCNA分析。

推荐应用领域

1. 信号转导研究；

2. 基因表达调控研究；

3. 肿瘤发展机制研究。

样品要求

样品类型		送样量
动物组织类	常规动物组织（心、肝、脾、肺、肾、肌肉等）	30mg-1g
植物组织类	柔软组织（叶、花、藻类、大型真菌等）	100mg-1g
微生物类	菌类	50mg-2g
细胞样品	悬浮细胞、贴壁细胞	1.5-5×107