PSEA分析-测试狗科研服务

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PSEA分析

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项目介绍

PSEA（Protein Set Enrichment Analysis）与传统的富集分析不同，传统的富集分析更加依赖差异蛋白，这涉及到差异阈值的设定，存在一定主观性并且只能用于显著差异的蛋白富集。而PSEA则不局限于差异蛋白，从蛋白集的富集角度出发，理论上更容易囊括细微但协调性的变化对生物通路的影响，故能兼顾差异较小的蛋白尤其是差异倍数不太大的蛋白集。可选的富集功能为 Gene Ontology功能，KEGG通路。

分析方法

使用GSEA软件对所有蛋白在比较组中表达量的变化 Ratio 值进行排序，排序之后的蛋白列表顶部可以看作是上调蛋白，底部是下调蛋白。PSEA分析的是一个功能集下的所有蛋白在这个排序列表的顶部或者底部富集，如果在顶部富集，该功能集是上调趋势；反之，如果在底部富集，则是下调趋势。

样品要求

详情请联系技术经理。

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