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蛋白质功能富集分析

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项目介绍

     高通量蛋白质组学分析往往会得到大量差异表达蛋白,简单的统计很难将这些差异蛋白与某个待研究的生物学现象及其潜在机制联系起来。功能富集分析可以帮助我们快速从庞杂的组学数据中发掘规律,期望发现在生物学过程中起关键作用的生物通路,从而揭示和理解生物学过程的基本分子机制。

方法

      富集分析采用 Fisher 精确检验方法检测待测功能集在差异蛋白中是否显著富集。这些功能集可以是 Gene Ontology 功能、KEGG 通路、蛋白结构域、Complex(复合体)等。富集分析结果通常用富集程度(fold enrichment),富集显著性(p value)两个特征来描述差异蛋白在指定功能集中的富集情况,当 p value < 0.05 时认为富集是具有统计学意义的

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