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蛋白组+修饰组关联分析

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项目介绍

     在生物体内各种翻译后修饰过程不是孤立存在的,当某个关键蛋白发生修饰后,会影响与其直接相互作用的蛋白或导致通路上下游蛋白发生变化。蛋白互作网络是用于分析这一复杂生物过程的有效手段。

分析方法

      修饰组学与蛋白组学鉴定到的蛋白通过与STRING蛋白网络互作数据库比对后,提取confidence score > 0.7(high confidence)的蛋白集合互作关系,用Cytoscape软件对蛋白互作网络进行可视化。然后使用MCODE插件挖掘网络中具有高连通性的模块,进而对模块中的蛋白进行功能富集分析,标记出每个模块可能参与的关键生物过程。

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