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    Visium空间转录组

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    项目介绍

    Visium空间转录组测序是依靠10x Genomics Visium平台,结合显微成像、靶向探针捕获、芯片和测序技术,从切片中获取不同位置细胞中转录组数据,并将组织学和基因表达分析结合,通过数据处理进行基因表达和形态学数据的可视化。

    技术原理

        10x Genomics Visium的核心是利用空间表达芯片捕获分子并标记空间位置和标签,基因表达芯片包含4个点阵区域(6.5mm x 6.5mm),每个点阵含有4992个barcoded spot(直径55um),每一个spot有一种空间定位条形码。基因表达芯片上的组织切片透化后释放mRNA被spot上对应的条形码原位捕获,进一步文库构建和测序。测序数据中空间条形码序列将转录信息映射回组织切片中的起始位置,从而还原转录本在组织中额位置分布,实现基因表达的空间可视化。

    应用方向

    1、肿瘤研究

    2、发育生物学

    3、神经科学

    4、疾病免疫

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