网站地图 关于 合作 招聘 帮助

热线:400-152-6858

测试狗科研服务

预存 定制
Document
当前位置:文库百科文章详情
Gaussian量化模拟入门教程(一):基本理论与操作实践
来源:计算狗 时间:2020-10-12 16:38:02 浏览:4466次


1. Gaussian软件适用范围

Gaussian量化模拟入门教程-1

基于Gaussian软件进行的量化模拟主要应用对象为孤立体系,即针对非周期性结构的结构及性质进行计算和分析。利用Gaussian计算结果,结合合适的分析方法或分析软件,可以获知研究对象的能量、静电势、分子轨道、电子结构、振动形式、激发态等诸多信息,或用于寻找反应的过渡态、反应路径。需要说明的是,Gaussian软件并非不支持周期性结构(如晶体、纳米管等)额计算,只是由于计算效率较低,人们通常会选择其他更为合适的软件(如VASPCASTEP)来进行周期性结构模拟。介于上述理由,Gaussian计算的输入模型通常是单个分子,或由多个原子/分子构成的团簇结构。本文将以一些简单的例子来介绍基于Gaussian软件进行模拟的操作流程,并对其中涉及到的输入、输出文件内容的关键信息进行介绍。

2. 软件安装

Gaussian量化模拟入门教程-2

利用Gaussian软件进行量化模拟,一般会需要安装3个软件,即:Gaussian09GaussViewMultiwfn三个软件。其中Gaussian09是用于计算的主程序,现有版本升级后的Gaussian16可供选用。GaussView的主要作用是进行建模并生成相应的输入文件,在计算任务完成后也可进行一些基础的数据分析和显示。Multiwfnhttp://sobereva.com/multiwfn/)则是sob老师开发的,功能极为强大的波函数分析软件。该软件可以极为方便的从计算输出文件中提取出我们所关注的信息,极大简化数据分析的难度。

上述三个软件的安装在Windows系统还是Linux系统下均不困难,按照软件安装教程的步骤即可顺利安装。请注意在所有安装路径中不要出现中文,也建议不要出现空格(可用下划线“_”代替空格)。

若是打算在本地电脑(Windows系统)上进行量化模拟,在本机上安装上述三个软件即可。

若是打算利用服务器或超算中心(Linux系统)进行计算,建议在自己的本地电脑上安装GaussViewMultiwfn,在服务器上安装Gaussian主程序即可。同时,由于需要通过SSH远程连接服务器,还需要在本地电脑安装SSH工具,如XshellXftp等。通过SSH工具连接服务器或超算中心的流程请咨询服务器或超算管理人员。

除上述软件外,建议在本地电脑安装一个专用的文本编辑器用于查阅和编辑输入和输出文件,推荐Notepad++

3. Gaussian软件涉及的文件类型

Gaussian量化模拟入门教程-3

Gaussian主要涉及的文件包括输入文件、输出文件、检查点文件、读写文件等,初学者至少应对前三者有一定了解。

输入文件:文件后缀名通常为.gjf,包含模拟任务的计算资源分配(核数、内存使用情况)、计算方法和精度、任务要求及计算模型等信息。

输出文件:文件后缀名通常为.out.log,除输出作为计算结果的结构模型、轨道、密度矩阵、电荷布局等信息外,还包括了部分计算过程中输出信息。可载入GaussView中,对计算结果或计算过程中的一些结构变化进行分析。

检查点文件:文件后缀名通常为.chk.fchk,包括轨道系数、密度矩阵等输出文件中未涵盖的重要信息,可载入Multiwfn进行数据分析。

读写文件:文件后缀名通常为.rwf,包含计算的所有信息。该文件通常非常大,在计算完成后会被自动删除。某些需要用到.rwf文件的情况下,可以通过在输入文件中给出保存路径和命名,使之被保存下来。


评论 / 文明上网理性发言
12条评论
全部评论 / 我的评论
最热 /  最新
全部 3小时前 四川
文字是人类用符号记录表达信息以传之久远的方式和工具。现代文字大多是记录语言的工具。人类往往先有口头的语言后产生书面文字,很多小语种,有语言但没有文字。文字的不同体现了国家和民族的书面表达的方式和思维不同。文字使人类进入有历史记录的文明社会。
点赞12
回复
全部
查看更多评论
相关文章

晶体结构可视化软件 VESTA使用教程(下篇)

2021-01-22

【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(上)

2019-10-25

手把手教你用ChemDraw 画化学结构式:基础篇

2021-06-19

【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(下)

2019-10-25

晶体结构可视化软件 VESTA使用教程(上篇)

2021-01-22

TEM照片处理软件 Digital Micrograph的进阶操作

2020-11-02

项目推荐/Project
XRD数据精修

XRD数据精修

热门文章/popular

晶体结构可视化软件 VESTA使用教程(下篇)

电化学实验基础之电化学工作站篇 (二)三电极和两电极体系的搭建 和测试

【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(上)

手把手教你用ChemDraw 画化学结构式:基础篇

【科研干货】电化学表征:循环伏安法详解(下)

晶体结构可视化软件 VESTA使用教程(上篇)

微信扫码分享文章

意见反馈

有奖举报

商务合作

公众号

关注我们 了解更多

小程序

随时预约 掌握进度

举报有奖

TEL: 191-3608-6524

如:在网络上恶意使用“测试狗”等相关关键词误导用户点击、恶意盗用测试狗商标、冒称官方工作人员等情形,请您向我们举报,经查实后,我们将给予您奖励。

举报内容:

200

上传附件:
文件格式不正确,请重新上传文件格式不正确,请重新上传文件格式不正确,请重新上传
文件格式:jpg、jpeg、png、gif、tif、doc、docx、ppt、pptx、xls、xlsx、pdf、zip、rar
联系方式
姓名
电话
提交意见

意见反馈

Suggestions

您可以在此留下您宝贵的意见,您的意见或问题反馈将会成为我们不断改进的动力。

意见类型
测试服务
网站功能
财务报账
其他类型
意见内容

200

联系方式
姓名
电话
提交意见

收起

Document
关于我们 新手帮助 测试干货 商务合作 基金查询 相关资质 模拟计算 现场测试 服务项目 科研绘图 同步辐射 全进口设备

联系方式/contact

400-152-6858

工作时间/work time

09:00-18:00

测试狗公众号

关注我们 了解更多

测试狗小程序

随时预约 掌握进度

蜀公网安备51010602000648号

蜀ICP备17005822号-1

成都世纪美扬科技有限公司

Copyright@测试狗·科研服务