基因组学检测_生物基因检测-测试狗科研服务

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项目介绍

基因组学：基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能、进化、定位和编辑等，以及它们对生物体的影响。

动植物基因组

动植物基因组de novo测序、遗传变异检测、BSA性状定位、遗传图谱构建、群体进化、全基因组关联分析、SSR分子标记开发

人基因组

全外显子组测序、人基因组重测序、目标区域捕获测序

微生物基因组测序

细菌基因组de novo测序、细菌基因组重测序、真菌基因组de novo测序、真菌基因组重测序、病毒基因组测序、线粒体&叶绿体基因组测序、质粒&BAC克隆子基因组测序

样品要求

1. 送样需标清样品编号，封口处用封口膜密封；

2. 送样前请与技术人员沟通送样条件，样品保存期间切勿反复冻融。

样本类型	送样要求
动植物基因组样本
植物组织	嫩叶鲜重2g
高等或大型动物	肌肉组织鲜重2g
微体型动物	动物体累计鲜重2g
昆虫	正常体型3g，微体型2g
血液（抗凝）	正常体型3g，微体型2g
微生物基因组样本（建议送样量3倍以上）
细菌框架图	菌体0.1g/核酸0.2μg
细菌完成图pacbio（革兰氏阴性菌）	菌体0.5g/核酸5μg
细菌完成图pacbio（革兰氏阳性菌）	菌体0.7g/核酸5μg
细菌完成图nanopore	菌体0.5g/核酸3μg
人基因组样本
基因组DNA	浓度≥20ng/μl,总量≥2μg
血液（抗凝）	新鲜血液2-3ml，-20℃保存

项目案例

常见问题

1、基因组框架图和精细图有什么不同？

框架图能覆盖基因组常染色体区域90%，覆盖基因区域95%，Contig N5到5 kb，Scaffold N50达到20 kb，单碱基错误率在十万分之一以下。精细图能覆盖基因组常染色体区域95%，覆盖基因区域98%，Contig N5到20 kb，Scaffold N50达到300 kb，单碱基错误率在十万分之一以下。

2、动植物基因组从头测序时为什么需要构建不同类型的文库？

因为动植物基因组大、复杂度高，且存在大量的重复区域，因此需要制备不同梯度的测序文库，进行双末端测序，使得在拼接中能够跳过大范围的重复区，从而避免了基因组中重复序列造成的错拼，提高了拼接的质量；同时结合BAC或Fosmid文库以及多种测序平台的综合运用，保证了测序的准确性和基因组的完整性，从而完成高等动植物的基因组图谱绘制。

3、外显子组测序需要多少的覆盖深度？

测序深度根据研究目的、样本量及客户的预期而定，建议有效测序深度100×以上，单基因遗传病推荐至少100×，肿瘤等体细胞突变疾病推荐200×以上。

4、人全基因组测序的优势是什么？

人全基因组测序可以挖掘各种遗传变异，一些大的结构变异，与全外显子测序相比，不局限于编码区变异，可以在全基因组范围内寻找与疾病或功能相关的位点。

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