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    项目介绍

    基因组学:基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能、进化、定位和编辑等,以及它们对生物体的影响。

    动植物基因组

    动植物基因组de novo测序、遗传变异检测、BSA性状定位、遗传图谱构建、群体进化、全基因组关联分析、SSR分子标记开发

    人基因组

    全外显子组测序、人基因组重测序、目标区域捕获测序

    微生物基因组测序

    细菌基因组de novo测序、细菌基因组重测序、真菌基因组de novo测序、真菌基因组重测序、病毒基因组测序、线粒体&叶绿体基因组测序、质粒&BAC克隆子基因组测序

    样品要求

    1. 送样需标清样品编号,封口处用封口膜密封;

    2. 送样前请与技术人员沟通送样条件,样品保存期间切勿反复冻融。

    样本类型送样要求
    动植物基因组样本
    植物组织嫩叶鲜重2g
    高等或大型动物肌肉组织鲜重2g
    微体型动物动物体累计鲜重2g
    昆虫正常体型3g,微体型2g
    血液(抗凝)正常体型3g,微体型2g
    微生物基因组样本(建议送样量3倍以上)
    细菌框架图菌体0.1g/核酸0.2μg
    细菌完成图pacbio(革兰氏阴性菌)菌体0.5g/核酸5μg
    细菌完成图pacbio(革兰氏阳性菌)菌体0.7g/核酸5μg
    细菌完成图nanopore菌体0.5g/核酸3μg
    人基因组样本
    基因组DNA浓度≥20ng/μl,总量≥2μg
    血液(抗凝)新鲜血液2-3ml,-20℃保存


    常见问题

    Q1、基因组框架图和精细图有什么不同?

    框架图能覆盖基因组常染色体区域90%,覆盖基因区域95%,Contig N5到5 kb,Scaffold N50达到20 kb,单碱基错误率在十万分之一以下。精细图能覆盖基因组常染色体区域95%,覆盖基因区域98%,Contig N5到20 kb,Scaffold N50达到300 kb,单碱基错误率在十万分之一以下。

    Q2、动植物基因组从头测序时为什么需要构建不同类型的文库?

    因为动植物基因组大、复杂度高,且存在大量的重复区域,因此需要制备不同梯度的测序文库,进行双末端测序,使得在拼接中能够跳过大范围的重复区,从而避免了基因组中重复序列造成 的错拼,提高了拼接的质量;同时结合BAC或Fosmid文库以及多种测序平台的综合运用,保证了测序的准确性和基因组的完整性,从而完成高等动植物的基因组图谱绘制。

    Q3、外显子组测序需要多少的覆盖深度?

    测序深度根据研究目的、样本量及客户的预期而定,建议有效测序深度100×以上,单基因遗传病推荐至少100×,肿瘤等体细胞突变疾病推荐200×以上。

    Q4、人全基因组测序的优势是什么?

    人全基因组测序可以挖掘各种遗传变异,一些大的结构变异,与全外显子测序相比,不局限于编码区变异,可以在全基因组范围内寻找与疾病或功能相关的位点。

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