蛋白组学分析_生物测试-测试狗科研服务

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模式	原理说明	优势	适用场景
Label free(非标记定量)	DDA模式采集，基于MS1峰面积或谱图计数进行相对定量，无需同位素标记	操作简便、成本低、样本间独立	中小规模样本、常规发现研究
DIA(数据非依赖采集)	将质量范围切分为多个窗口，依次对所有母离子进行二级碎裂，无遗漏采集	定量重现性好、覆盖深度高、适合大批量	大队列、临床样本、高深度定量
4D-DIA / diaPASEF	在DIA基础上增加"离子淌度"维度（CCS值），timsTOF Pro2专属，离子利用效率提升	灵敏度提升~12倍、检测深度增加	微量样本、复杂样本、修饰蛋白组
PRM(平行反应监测)	高分辨质谱靶向采集目标蛋白的预选肽段，全碎片谱记录，无需抗体	高特异性、可绝对定量、多蛋白并行	差异蛋白验证、生物标志物定量确认

模式

原理说明

优势

适用场景

Label free(非标记定量)

DDA模式采集，基于MS1峰面积或谱图计数进行相对定量，无需同位素标记

操作简便、成本低、样本间独立

中小规模样本、常规发现研究

DIA(数据非依赖采集)

将质量范围切分为多个窗口，依次对所有母离子进行二级碎裂，无遗漏采集

定量重现性好、覆盖深度高、适合大批量

大队列、临床样本、高深度定量

4D-DIA / diaPASEF

在DIA基础上增加"离子淌度"维度（CCS值），timsTOF Pro2专属，离子利用效率提升

灵敏度提升~12倍、检测深度增加

微量样本、复杂样本、修饰蛋白组

PRM(平行反应监测)

高分辨质谱靶向采集目标蛋白的预选肽段，全碎片谱记录，无需抗体

高特异性、可绝对定量、多蛋白并行

差异蛋白验证、生物标志物定量确认

样本类型	最低要求	建议量	保存与运输	备注
动物组织	≥50mg	≥100mg	液氮速冻，-80℃保存，干冰运输	避免反复冻融
细胞沉淀	≥1×10⁶	≥5×10⁶	PBS洗3次去血清，-80℃保存，干冰运输	贴壁细胞需刮取
血浆/血清	≥100μL	≥200μL	-80℃保存，干冰运输	勿用肝素抗凝管
植物组织	≥200mg	≥500mg	液氮速冻，-80℃，干冰运输	含多糖多酚样本需特殊处理
微生物菌体	≥50mg湿重	≥100mg	PBS洗3次，-80℃，干冰运输	需注明培养基成分

样本类型

最低要求

建议量

保存与运输

备注

动物组织

≥50mg

≥100mg

液氮速冻，-80℃保存，干冰运输

避免反复冻融

细胞沉淀

≥1×10⁶

≥5×10⁶

PBS洗3次去血清，-80℃保存，干冰运输

贴壁细胞需刮取

血浆/血清

≥100μL

≥200μL

-80℃保存，干冰运输

勿用肝素抗凝管

植物组织

≥200mg

≥500mg

液氮速冻，-80℃，干冰运输

含多糖多酚样本需特殊处理

微生物菌体

≥50mg湿重

≥100mg

PBS洗3次，-80℃，干冰运输

需注明培养基成分

修饰类型	细胞	组织	特别注意
磷酸化蛋白组	≥2×10⁷	≥200mg	需添加磷酸酶抑制剂；样本采集后尽快处理
泛素化蛋白组	≥2×10⁷	≥200mg	可检测9种泛素连接方式；需注明研究目的
乙酰化蛋白组	≥2×10⁷	≥200mg	组蛋白/非组蛋白乙酰化均可检测
乳酸化蛋白组	≥2×10⁷	≥200mg	新兴修饰，样本处理条件要求严格
琥珀酰化蛋白组	≥2×10⁷	≥200mg	线粒体富集样本建议单独准备
糖基化蛋白组	≥2×10⁷	≥200mg	糖链结构不稳定，务必-80℃保存

修饰类型

细胞

组织

特别注意

磷酸化蛋白组

≥2×10⁷

≥200mg

需添加磷酸酶抑制剂；样本采集后尽快处理

泛素化蛋白组

≥2×10⁷

≥200mg

可检测9种泛素连接方式；需注明研究目的

乙酰化蛋白组

≥2×10⁷

≥200mg

组蛋白/非组蛋白乙酰化均可检测

乳酸化蛋白组

≥2×10⁷

≥200mg

新兴修饰，样本处理条件要求严格

琥珀酰化蛋白组

≥2×10⁷

≥200mg

线粒体富集样本建议单独准备

糖基化蛋白组

≥2×10⁷

≥200mg

糖链结构不稳定，务必-80℃保存

检测类型	血浆/血清量	保存要求	适用场景
Ultra-Fast血液蛋白组	≥100μL	-80℃，干冰	大量样本快速筛查，3000+蛋白
Ultra-Deep血液蛋白组	≥200μL	-80℃，干冰	深度低丰度蛋白发现，4000+蛋白
Olink蛋白组（Target 96）	≥1μL/蛋白对	-80℃，干冰	14种疾病Panel可选，仅需微量血浆
Olink蛋白组（Explore HT）	≥10μL	-80℃，干冰	高通量数千种蛋白，大队列标志物筛查
SomaSeq 11K	≥55μL	-80℃，干冰	~11000种蛋白，fM级灵敏度

检测类型

血浆/血清量

保存要求

适用场景

Ultra-Fast血液蛋白组

≥100μL

-80℃，干冰

大量样本快速筛查，3000+蛋白

Ultra-Deep血液蛋白组

≥200μL

-80℃，干冰

深度低丰度蛋白发现，4000+蛋白

Olink蛋白组（Target 96）

≥1μL/蛋白对

-80℃，干冰

14种疾病Panel可选，仅需微量血浆

Olink蛋白组（Explore HT）

≥10μL

-80℃，干冰

高通量数千种蛋白，大队列标志物筛查

SomaSeq 11K

≥55μL

-80℃，干冰

~11000种蛋白，fM级灵敏度

检测类型	样本要求	运输条件
microDIA微量蛋白组	最低至μg级蛋白；穿刺样本、卵细胞、微量组织	-80℃，干冰
多肽组学（4D-pepLFQ）	组织≥200mg（肠/肾/肝/脾/睾丸等）	液氮速冻，-80℃，干冰
宏蛋白组	粪便≥2g；肠道内容物≥1g；土壤/淤泥≥2g	-80℃，干冰
PRM目标蛋白	同常规定量蛋白组要求	-80℃，干冰

检测类型

样本要求

运输条件

microDIA微量蛋白组

最低至μg级蛋白；穿刺样本、卵细胞、微量组织

-80℃，干冰

多肽组学（4D-pepLFQ）

组织≥200mg（肠/肾/肝/脾/睾丸等）

液氮速冻，-80℃，干冰

宏蛋白组

粪便≥2g；肠道内容物≥1g；土壤/淤泥≥2g

-80℃，干冰

PRM目标蛋白

同常规定量蛋白组要求

-80℃，干冰

研究类型	每组最低重复	推荐重复
细胞实验	≥3	4-6
动物实验	≥3	5-8
临床样本（发现阶段）	≥10	20-30
临床样本（验证阶段）	≥30	50-100
植物田间实验	≥3	5-6

研究类型

每组最低重复

推荐重复

细胞实验

≥3

4-6

动物实验

≥3

5-8

临床样本（发现阶段）

≥10

20-30

临床样本（验证阶段）

≥30

50-100

植物田间实验

≥3

5-6

Ultra-Fast定量蛋白组	常规速度，适宜中小批量样本，检出~8000蛋白（Hela细胞）
Ultra-Deep定量蛋白组	高深度鉴定，检出10000+蛋白，适合深度探索
4D-DIA定量蛋白组	4D+diaPASEF模式，灵敏度提升~12倍，定量更稳定
4D-label free定量蛋白组	4D平台+Label free，兼具深度与灵活性
Ultra-Fast血液蛋白组	去除高丰度蛋白干扰，检出3000+血浆蛋白
Ultra-Deep血液蛋白组	低丰度蛋白深度富集，检出4000+血浆蛋白
microDIA微量蛋白组	微量样本专用（穿刺/卵细胞/微量组织），解决微克级难题
蛋白鉴定	仅定性鉴定样本中的蛋白种类，不做定量比较

磷酸化蛋白组	最常见的PTM，信号转导核心。磷酸化位点检出可达17000+
乳酸化蛋白组	新兴修饰类型，与代谢-免疫交叉调控密切相关（Warburg效应）
琥珀酰化蛋白组	线粒体代谢调控相关修饰，参与TCA循环和能量代谢
4D-label free泛素化蛋白组	蛋白降解通路核心修饰，9种泛素连接方式可区分
4D-label free乙酰化蛋白组	组蛋白及非组蛋白乙酰化，表观遗传与代谢调控关键

N-糖基化蛋白组	天冬酰胺（Asn）连接的糖基化，含糖链完整信息
完整N-糖肽蛋白组	保留完整糖肽结构，同时获取糖基化位点+糖链组成信息
O-GlcNAc糖基化蛋白组	丝氨酸/苏氨酸连接的O-GlcNAc单糖修饰，与营养感知和信号转导相关

PRM目标蛋白	高分辨质谱靶向采集，无需抗体，可绝对定量，单次检测数十种目标蛋白
Olink蛋白组（target 96）	邻位延伸分析技术（PEA），96种蛋白/Panel，14种疾病Panel可选
Olink蛋白组（Explore HT）	高通量版，可同时检测数千种蛋白，适合大队列血浆标志物筛选
SomaSeq 11K	基于适配体的高通量蛋白检测，可检测~11000种蛋白，fM级灵敏度

4D-pepLFQ多肽组学	以内源性多肽（<10kDa）为研究对象，发现活性多肽、生物标志物
宏蛋白组	对微生物群落全部蛋白进行分析，揭示菌群功能活性而非仅物种组成

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