【技能】Win10系统Bash中快速安装和使用LAMMPS的方法-测试狗·科研服务

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【技能】Win10系统Bash中快速安装和使用LAMMPS的方法

来源：本站时间：2019-10-25 16:19:09 浏览：6474次

前言

对于LAMMPS初学者来说，第一件事就是在自己电脑上安装一个可以运行的LAMMPS程序。但是大多数初学者都是自己课题组模拟计算的先锋队，没有安装和使用LAMMPS的经验，并且习惯了Windows操作系统，更不愿意将自己的电脑系统转变为Linux系统。因此，部分初学者会在自己的电脑上安装虚拟机，在虚拟机中安装和使用LAMMPS；另外一些初学者可能会尝试在自己的电脑上安装上双系统。这两种方式笔者都尝试过，用起来存在很多不方便得地方，特别是双系统，经常需要在Windows系统和Linux系统来回切换，笔者已无力吐槽这种方式。

Build 2016大会上，微软公司公布了重磅消息，Win10系统下可以直接使用基于Ubuntu的Bash Shell，不再需要安装笨重的虚拟机，并且Bash用起来更加顺畅，与Windows系统共享存储的文件，与受众的亲和力有了很大的提高。

本文对Win10系统下如何安装和使用LAMMPS进行了简单总结，供初学者参考。整个安装过程包括两部分：（1）在Win10系统下启动Ubuntu系统；（2）Ubuntu系统下LAMMPS的安装和测试。

安装过程

✦ 在Win10系统下启动Ubuntu系统

Win10系统安装过程中本身不包含Ubuntu系统，需要手动添加，添加的方法非常简单。

（1）具体安装过程为：打开设置——更新和安全——开发者选项——选择 “开发人员模式”。

（2）然后进入控制版面——程序——启动或关闭Windows功能——勾选“适用于Linux的Windows子系统”——点击确定。安装过程中需要重启计算机，并且需要下载Linux安装程序。

（3）安装之后可以直接在搜索中输入“bash”就可以找到安装的bash shell，也可以直接在cmd中输入“bash”转换到bash shell。

✦ Ubuntu系统下LAMMPS的安装和测试

第一种方法非常简单，根据LAMMPS官方手册，可以直接采用编译好的可执行文件进行安装。复制以下命令，依次执行，即可获得执行文件lmp_daily：

1）sudo add-apt-repository ppa:gladky-anton/lammps

2）sudo apt-get update

3）sudo apt-get install lammps-daily

4）cd /lammps/examples/HEAT（打开LAMMPS中有关传热的例子）

运行程序测试：mpirun -np 8 lmp_daily -in in.spce.hex

或者：mpirun -np 8 lmp_daily < in.spce.hex

第二种安装方法稍微复杂一点，但是对初学者来说也并不难

1）sudo apt install -y build-essential ccache gfortran openmpi-bin libopenmpi-dev libfftw3-dev libjpeg-dev libpng12-dev python-dev python-virtualenv libblas-dev liblapack-dev libhdf5-serial-dev hdf5-tools（更新和安装LAMMPS所需要的安装包，这部分可以根据需要选择性安装）

2）wget http://lammps.sandia.gov/tars/lammps-stable.tar.gz（从官网下载LAMMPS安装包）

3）tar xvzf lammps-stable.tar.gz（解压安装包）

4）cd lammps（注意：这里解压后的文件夹名为lammps，而实际解压的文件名可能不同，需要根据实际解压的文件名进行调整，可以在命令行输入“ls”进行查看）

5）cd src/

6）make -j 4 mpi（编译可执行的文件，成功后会在src文件夹下面得到执行文件名字为 “lmp_mpi”。但是在每次计算中，都需要将可执行文件的绝对路径添加上才能计算，比较麻烦。可以通过设定临时路径或者修改 “.bashrc”文件解决这个问题，两者择一即可）

保存临时路径（第一种方法）

7）cd（跳转到根目录）

8）mkdir lmp（建立临时文件夹lmp）

9）cp lammps/src/lmp_mpi ./lmp/（将可执行文件复制cp到lmp中）

10）pwd（显示当前路径）

11）LAMMPS_DIR=$PWD（保存临时路径，并进行测试）

12）cd /lammps/examples/HEAT（打开LAMMPS中有关传热的例子）测试：mpirun -np 8 $LAMMPS_DIR/lmp_mpi -in in.spce.hex