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南京农业大学（第一单位）：迎来首篇《Cell》！

来源：科学10分钟时间：2022-05-05 09:18:02 浏览：2352次

2022年2月15日，南京农业大学粟硕，中山大学施莽及悉尼大学Edward C. Holmes共同通讯（南京农业大学为第一通讯单位，何婉婷、侯新及赵晋为共同第一作者）在Cell 在线发表题为“Virome characterization of game animals in China reveals a spectrum of emerging pathogens”的研究论文，该研究对在中国采样的 1941 只“野味”动物（代表 18 个物种和 5 个哺乳动物目）进行了元转录组学分析。由此确定了 102 种哺乳动物感染病毒，其中 65 种为首次描述。21 种病毒被认为对人类和家畜具有潜在的高风险。

果子狸（Paguma larvata）携带的潜在高风险病毒数量最多。研究人员推断蝙蝠冠状病毒 HKU8 从蝙蝠到果子狸的传播，以及冠状病毒从蝙蝠到刺猬、从鸟类到豪猪、从狗到貉的跨物种跳跃。值得注意的是，该研究在果子狸和亚洲獾中发现了禽流感 A 型病毒 H9N2，后者表现出呼吸道症状，以及可能的人类与“野味”动物病毒传播的病例。这些数据突出了“野味”动物作为疾病出现的潜在驱动因素的重要性。该研究极大的拓展了对多种“野味”动物携带病毒多样性的认识，为人类和家畜疫病预警和防控提供了重要科学依据。

这是南京农业大学首次以第一通讯作者单位在Cell 发表研究成果，也是我国动物传染病防控领域的突破性研究进展。

哺乳动物“野味”动物是野生或半野生动物，在中国和其他亚洲国家通常作为外来食物进行交易和消费。它们包括啮齿动物（如豪猪、竹鼠和土拨鼠）、食肉动物（如果子狸、貉、獾和狐狸）、穿山甲、刺猬和兔子。这些动物通常要么在当地捕获和饲养，要么从邻国非法进口，然后再转移到活体动物（或“湿”）市场进行交易。近几十年来，商业“野味”动物养殖业务及其物种多样性有了重大扩展。恶劣的卫生条件和动物与人类之间的密切接触，以及活体动物市场和它们所服务的餐馆中种类繁多的物种，使它们成为新兴传染病的理想滋生地。

毫不奇怪，食用、捕获、加工和/或交易“野味”动物与数次传染病暴发有关，并造成严重的公共卫生后果。SARS-CoV 和 SARS-CoV-2 的早期病例分别在广东省和湖北省的动物市场及已经在果子狸、貉子和穿山甲中发现了 SARS-CoV 和 SARS-CoV-2 的近亲。这些是最受欢迎的外来“野味”动物，经常被交易和人类消费，尽管它们作为将这些病毒传播给人类的直接宿主的作用通常不确定。以类似的方式，人类免疫缺陷病毒 (HIV) 的多个谱系是获得性免疫缺陷综合征 (AIDS) 的病原体，可能起源于非洲中部和中西部的灵长类动物。

文章模式图（图源自Cell ）

由于“野味”动物经常与重要的人类疾病相关，因此识别这些物种中现有或潜在的病原体显然很重要，这样它们可用于追踪特定流行病的起源，并对未来爆发的最可能来源进行风险评估。自 2002/2003 年第一次 SARS-CoV 爆发以来，病毒发现研究已在各“野味”物物种中进行，包括果子狸、穿山甲、土拨鼠和獾。最初，这些研究利用病毒分离、共识 PCR 和 Sanger 测序，而近年来更多的注意力集中在宏基因组高通量测序上。

除了类 SARS 病毒外，这些研究还确定了几种对人类感染具有直接重要性的传染原，例如来自果子狸和貉的轮状病毒 A 以及野猪中的正肝炎病毒 A。已知这两种病毒都会感染人类以及广泛的哺乳动物宿主。尽管如此，很少有系统地研究“野味”动物的病毒组，尤其是在中国，它们的消费很普遍。

自 2002 年 SARS-CoV 出现以来，中国一直是“野味”动物广泛病毒监测的重点，在蝙蝠身上发现了许多与 SARS-CoV-2 相关的病毒。然而，除穿山甲外，几乎没有对“野味”动物进行研究。为了填补这一空白，该研究对在中国收集的代表五个哺乳动物目的 18 种“野味”动物的病毒组进行了系统的元转录组学（即总 RNA 测序）调查。许多物种首次在宏基因组框架内进行了研究。

野生动物携带潜在人畜共患病病毒与宿主之间的关联分析（图源自Cell ）

该研究确定了 102 种哺乳动物感染病毒，其中 65 种为首次描述。21 种病毒被认为对人类和家畜具有潜在的高风险。果子狸（Paguma larvata）携带的潜在高风险病毒数量最多。研究人员推断蝙蝠冠状病毒 HKU8 从蝙蝠到果子狸的传播，以及冠状病毒从蝙蝠到刺猬、从鸟类到豪猪、从狗到貉的跨物种跳跃。

值得注意的是，该研究在果子狸和亚洲獾中发现了禽流感 A 型病毒 H9N2，后者表现出呼吸道症状，以及可能的人类与“野味”动物病毒传播的病例。这些数据突出了“野味”动物作为疾病出现的潜在驱动因素的重要性。该研究极大的拓展了对多种“野味”动物携带病毒多样性的认识，为人类和家畜疫病预警和防控提供了重要科学依据。

本研究受到国家自然科学基金优青基金（31922081）等项目支持资助，同时貉冠状病毒流行病学研究得到了国家重点研发计划项目课题“畜禽冠状病毒的流行传播特征与遗传演化规律（2021YFD1801101）”支持资助。

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