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多肽组学是以机体内源性多肽和低分子量蛋白质为研究对象，研究多肽组的结构、功能、变化规律及其相关关系。多肽组学和蛋白质组学都是基因组学的补充，多肽可以体现不同生理病理条件下蛋白的合成、加工和降解过程，同时对基因的表达、物质代谢等过程又有调节作用，因此多肽组学被认为是连接蛋白组学和代谢组学的"桥梁"。

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