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蛋白组+代谢组联合分析

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项目介绍

     代谢组学可以研究某一生物、组织或细胞在特定环境下的特定时期内所有低分子量代谢产物。相比其他组学,代谢组与表型有着更近的联系。蛋白组和代谢组紧密联系,蛋白水平会影响代谢产物的表达谱,而代谢物浓度又会影响蛋白表达量。代谢组学分析可以帮助蛋白组数据在功能上进行解释;而蛋白质组学分析通过突出参与的酶或酶促途径,有助于更好地理解代谢组学数据。蛋白组学与代谢组学整合分析能够更好地解释疾病或外界刺激的分子机理和不同组学对通路的调控机制,更直观地了解代谢物、酶及基因之间上下游的调控关系。

分析方法

      筛选出差异表达的蛋白和代谢小分子,基于O2PLS关联分析进行多变量整合分析。对差异蛋白与差异代谢小分子进行斯皮尔曼(Spearman)相关性分析,并进一步构建相关性网络。然后,将差异蛋白和差异代谢小分子映射到iPath 整体代谢通路和KEGG 通路上,并进行KEGG 富集分析。最后,利用Cytoscape 中的Metscape 插件进行蛋白组和代谢组的互作网络分析。

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