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蛋白质磷酸化修饰（Phosphorylation）

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项目介绍

蛋白质磷酸化修饰（Phosphorylation）是生物体内最重要的共价修饰方式之一，是目前分布最多、也是最广泛研究的修饰，其发生过程是在激酶（kinase）催化下，将ATP的磷酸根基团转移到蛋白的氨基酸（Ser、Tyr、Thr）侧链上。蛋白质的磷酸化和去磷酸化这一可逆过程调节着包括细胞增殖、发育、分化、信号转导、细胞凋亡、神经活动、肌肉收缩及肿瘤发生等过程在内的所有生命活动。发生磷酸化修饰的氨基酸上共价连接磷酸基团，其分子质量会增加发生79.97Da。利用质谱可测定分子量是否发生79.97Da的质量偏移，从而检测磷酸化修饰肽段及位点。 4D-label free磷酸化蛋白质组学是基于timsTOF Pro质谱仪，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行差异磷酸化蛋白质组学分析。4D-label free修饰组，利用了离子淌度分离，能根据分子的形状、截面积属性，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

技术路线

技术优势

1. 4D技术加持，提高定量的准确性、鉴定深度，更加适合微量样本；

2. 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便；

3. 基于质谱平台（Bruker timsTOF pro），检测速度提升近一倍；

4. 经验丰富——超17年蛋白平台服务经验，拥有丰富的高水平项目文章；

5. 数据保证——采用进口金标抗体，数据结果稳定可靠；

6. 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析，实现快捷”一站式”服务。

数据分析

1、标准数据分析内容

鉴定分析：鉴定与定量结果统计;单个样本蛋白质鉴定结果统计;韦恩图。

表达差异分析：差异结果统计;差异结果柱状图;火山图;聚类分析图。

多组的比较分析(组别>=3)：mufzz聚类;雷达图;箱线图。

功能分析：亚细胞定位;结构域分析;GO功能分析;KEGG通路分析;互作网络分析。

质量控制分析：肽段离子质量偏差分布、肽段例子得分分布、蛋白质丰度比分布。

2、高级数据分析

功能分析：GSEA富集分析。

临床药物研究：药物靶点注释。

标志物筛选：集成机器学习。

与临床表征的联合分析：热图;弦图;ROC分析;WGCNA分析。

推荐组合产品

1. 蛋白质组+磷酸化组：全面剖析机体调控网络。

2. 磷酸化组+代谢组：打通机体表型-机制研究通路。

推荐应用领域

1. 神经及退行性疾病；

2. 肿瘤发病机制研究；

3. 药理药靶研究。

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